A las 11:46 P. m. hora local, un Airbus A320-200 que llevaba 135 pasajeros y 5 tripulantes realizaba el vuelo 759 de Air Canada,[4]​ y fue autorizado para aterrizar en la pista 28R, la pista paralela 28L (L corresponde a izquierda y R a derecha desde el punto de vista del piloto), había sido cerrada a las 10 P. m. y sus luces habían sido apagadas,[6]​ excepto por una franja 6 metros intermitente en el extremo cercano.

[10]​ Estudios preliminares posteriores mostraron que, además, el Servicio Automático de Información de Terminal (ATIS) avisó que la pista 28 izquierda estaba cerrada y apagada.

[14]​ Luego el piloto, del UA001 dijo por radio que el Air Canada voló directamente sobre ellos y el controlador respondió confirmando que así había ocurrido[1]​ Durante su primera aproximación el AC759 voló por 400 metros sobre la línea C, alcanzando a descender a una altitud de 24 metros y llegó a estar a 8 metros de los cuatro aviones que esperaban para despegar antes de que se le ordenara abortar el aterrizaje.

[11]​ El AC759 desapareció del ASSC del controlador por 12 segundos, entre las 11:55:52 y las 11:56:04 P. m. (poco después que el Air Canada preguntara si la pista estaba despejada y el United Airlines 1 les avisara que iban sobre la pista C), porque estaba demasiado lejos de la 28R.

El incidente no es considerado reportable según las leyes federales pero el presidente de la NTSB le consideró el incidente más significante casi trágico que han tenido en décadas y le urge a la NTSB revaluar los requisitos para reportarlo.

[10]​ Otros pilotos indicaron que algunas aerolíneas requieren que todas sus aeronaves usen el sistema de aterrizaje instrumental (ILS) sin importar el clima o la visibilidad, la cual podría advertir a cabina cuando el avión está alineado con la pista de rodaje.

[2]​ Dave Jones, el comisionado de seguros de California y los pasajeros del AC759, escribieron una carta a Air Canada una semana después del incidente solicitando su cooperación con la investigación.