Su familia se trasladó a Tucson, Arizona, donde efectuó sus estudios primarios.
El 19 de marzo de 1900 la legislatura estatal le dispensó el examen para que pudiera ejercer su profesión, y el Ejecutivo le expidió el diploma correspondiente.
Este personaje comenzó a prestar sus servicios al estado de Sonora en 1890.
A Bonillas le tocó efectuar la medición del fundo legal del Santa Anna y en el mismo año, encontrándose en ese pueblo, salió liderando un grupo de voluntarios y derrotó en la sierra a una partida de apaches que andaban merodeando la zona.
En el año de 1910 se afilió al Partido Antirreeleccionista y poco después fue elegido Diputado (1911-1913), correspondiéndole votar por el desconocimiento del general Victoriano Huerta como presidente interino de México.