En esa fase intervinieron Rodrigo Gibaja, Alonso Rodríguez y Antón Gallego.

En 1525 empezó la segunda etapa, cuando Diego de Riaño realizó el abobedamiento del cimborrio.

[2]​ En los siglos XVI, XVII y XIX se realizaron el resto de reformas.

La situada a los pies del templo es neogótica y fue realizada en el siglo XIX.

[2]​ El interior contempla un gran planta de salón formada por tres naves y capillas laterales.

La estructura de las nervaduras del cimborrio en la nave central, presenta mayor complejidad y se encuentra decorada con medallones que representan ángeles en las claves de los arcos.

[2]​ A ambos lados del presbiterio hay dos leones de madera con ciriales.

La barandilla de hierro que cierra el púlpito fue realizada por Pedro Fernández en 1664.