Además, se conoce que las obras de la cabecera se llevaron a cabo entre el 1531 y el 1538, la nave fue rematada en 1574 y del último cuarto del siglo XVII datan las bóvedas de la nave.
La capilla mayor, muy profunda, está cubierta con una bóveda de crucería, la cual fue construida a instancias del regidor Alonso Nieto.
El edificio no pertenece a ningún estilo arquitectónico concreto, debido a las varias modificaciones que sufrió durante los siglos XVI y XVII.
Sobre éste hay una pintura mural que representa el Bautismo de Jesús.
Por su parte, en los extremos se encuentran las alegorías del Antiguo y Nuevo Testamento.