Unos años después, se construyó una iglesia en la actual Calle Caseros para alojar a una replica de la Virgen de las Mercedes que había sido traída unos años antes desde Europa.
Después de la Independencia Argentina, los mercedarios se marcharon y la parroquia fue administrada por padres redentoristas.
A comienzos del siglo XX, el templo estaba casi en ruinas y posteriormente fue demolido.
El predio funcionaría luego como colegio de sacerdotes, como colegio nacional y actualmente como escuela privada.
La orden de la Merced adquirió un terreno en la actual Calle Caseros y en 1907 se empezó a construir el actual templo, que fue terminado en 1914 e inaugurado con la bendición de Monseñor Piedrabuena.