[4]​ Entre 1899 y 1900, se construyeron dos torres —las primeras que se construyeron en Chile con armadura de hierro en su estructura y revestidas de cemento—,[1]​ diseñadas por el arquitecto francés Eugenio Joannon.

Con la cooperación del presidente Federico Errázuriz Zañartu y del ministro Aníbal Pinto, la campana fue devuelta a la orden de los jesuitas, quienes la fundieron y construyeron las campanas de dicha torre.

La iglesia posee pinturas realizadas por diversos artistas: Los muros de la iglesia están adornados desde 1914 por un vía crucis pintado al óleo en Roma y donado por Felipa Ossa Ceroz.

Se encuentran ubicados bajo el altar donde está el retrato de san Ignacio.

En marzo de 1999, fue descubierta una cripta funeraria, a la cual se accedía a través de la capilla llamada del santo Cristo (antes, "buena Muerte").

En la cripta, se encontraron dos cajones llenos de huesos, correspondientes a unas cuarenta personas.