Las iglesias bautistas, los discípulos de Cristo y el unitarismo universalista ejercen asimismo la organización política congregacional.
Estas convenciones generalmente proporcionan lazos más fuertes entre las congregaciones, incluida alguna dirección doctrinal y la puesta en común de recursos financieros.
Las congregaciones que pertenecen a asociaciones y convenciones todavía son gobernadas independientemente.
La mayoría de las iglesias no confesionales están organizadas según características congregacionalistas.
En el congregacionalismo, más bien singularmente, se entiende que la iglesia es una asociación verdaderamente voluntaria.
Finalmente, la teoría congregacional prohíbe estrictamente a los ministros gobernar sus iglesias locales por sí mismos.
Es una contradicción del principio congregacional si un ministro toma decisiones con respecto a la congregación sin el voto de estos otros oficiales.
Los otros oficiales pueden llamarse diáconos, presbítero o sesión (tomando la terminología presbiteriana), o incluso vestry (tomando el término anglicano); no es su etiqueta lo que es importante para la teoría, sino su estado laico y su voto por igual Con el pastor, al decidir los asuntos de la iglesia.
Tales sentimientos se fortalecieron especialmente a fines del siglo XIX y principios del XX, cuando el ecumenismo evolucionó desde una perspectiva liberal no sectaria sobre las relaciones con otros grupos cristianos que acompañaron la relajación de las tendencias calvinistas sostenidas por las generaciones anteriores.