En 1951, el sacerdote católico alemán Josef Mauermann, fue enviado desde China a Perú para atender a la Iglesia San Felipe Apóstol, ubicada en el distrito de San Isidro y que atendía la comunidad chino-peruana.
[1] Al llegar allí, se encontró con la presencia de inmigrantes alemanes, austriacos y suizos germanoparlantes de fe católica que no contaban con una iglesia en su idioma, por lo que decidió contactarlos y realizar las primeras reuniones para poder agruparlos y así organizarse como comunidad.
En sus inicios, al no contar con un templo propio, las misas en alemán eran celebradas una vez por semana en la Capilla de Jesús Hostia del Colegio La Reparación de la capital peruana.
Una vez adquirido el terreno, se organizó un Consejo Parroquial para la construcción del templo.
[2] En 1986, la arquidiócesis de Friburgo realizó un hermanamiento con la Iglesia católica en Perú, siendo la parroquia San José la principal sede en el país sudamericano.