A principios del siglo XII (1105-09) se llama Ivargoyti.

Con la actual grafía de Ibargoiti aparece mencionado por primera vez en un documento del año 1198.

Desde entonces, esta ha sido la forma habitual de llamar a este valle.

Para entender este topónimo hay que tener en cuenta que Ibargoiti forma la parte más alta del valle del río Elorz.

Actualmente Ibargoiti pertenece a la zona no vascófona de Navarra, pero este idioma se habló en el lugar hasta el siglo XIX.