[2]​ H. lingyuanensis y H. baitaigouensis fueron en gran medida similares en anatomía, ambas especies alcanzaron un tamaño corporal adulto máximo de aproximadamente 0.8 metros.

Un espécimen representa H. lingyuanensis, y el otro (con impresiones más claras) no puede asignarse a una especie porque parte del cuello (cuya longitud es un indicador clave de especie) se destruyó cuando los distribuidores fósiles injertaron un cráneo de un espécimen diferente en la losa.

[2]​ El Hyphalosaurus estaba cubierto principalmente en escamas poligonales pequeñas, de patrones irregulares, aunque variaban en todo el cuerpo.

[2]​ La cola misma ha conservado el tejido blando que se extiende mucho más allá de los márgenes del esqueleto.

[3]​ En el ejemplar holotipo de H. baitaigouensis, se conservan varios huevos que contenían embriones en el interior y alrededor del cuerpo.

Uno de los embriones posteriores se colocó en posición invertida, con la cabeza hacia delante, una complicación que pudo haber matado a la madre.

[2]​ Hyphalosaurus es el tetrápodo más abundante (vertebrado de cuatro extremidades) en la Formación Yixian, y probablemente jugó un papel importante en la cadena alimentaria acuática.

Rápidamente se reconoció que Sinohydrosaurus e Hyphalosaurus eran imágenes especulares entre sí y de hecho representaban diferentes mitades del mismo espécimen.

[7]​ Hyphalosaurus está relacionado con el gran Champsosaurus tipo cocodrilo y el Monjurosuchus más pequeño, parecido a un lagarto.

Su pariente más cercano fue la especie similarmente construida, Shokawa ikoi, del Cretácico Inferior de Japón.

Los coristoderos eran un clado de reptiles acuáticos que sobrevivieron a la extinción del Cretácico final junto con cocodrilos, tortugas, lagartos y serpientes.