En singles ha logrado victorias ante rivales destacados como Rafael Nadal, Juan Martín del Potro, David Nalbandian, Fernando González, David Goffin, Ivo Karlović, Gaël Monfils, Gilles Simon, Aleksandr Dolgopólov, Fernando Verdasco y Janko Tipsarević.

Actualmente se desempeña exclusivamente como doblista, habiendo alcanzado la marca de 20 títulos en dobles, convirtiéndose así en el jugador argentino más ganador en dicha especialidad, superando en esa marca al mejor tenista argentino de todos los tiempos, Guillermo Vilas (16).

Este año ganó además los Challenger de Bucaramanga, Bogotá, Manta, Campos do Jordao, Buenos Aires.

Clasificó a su primer Grand Slam en el US Open, donde avanzó una ronda antes de perder con Tomáš Berdych en cuatro sets.

Ingresó directo en el ATP World Tour de San Petersburgo y llegó a su primera final en estas series, perdiendo con Sergiy Stajovski.

En marzo perdió con Ricardo Mello en primera ronda del ATP World Tour Masters 1000 de Indian Wells.

Llegó a semifinales de dobles en el US Open haciendo dupla Eduardo Schwank.

Representó a Argentina en las semifinales del Grupo Mundial de Copa Davis, en la derrota contra Francia.

Sus mejores resultados ATP fueron segundas rondas en Viña del Mar, Houston y Roland Garros.

En su torneo de casa en Buenos Aires jugó un solo partido y perdió contra Nicolás Almagro.

Esta vez su compañero fue su compatriota Diego Schwartzman y derrotaron en la final a la pareja Andreas Beck / Martin Fischer por 6-4, 3-6, 10-5.

En la 4.º ronda se enfrentó al belga David Goffin (n.º 15 del mundo) perdiendo por 5-7 3-6 dando fin a la aventura de Zeballos en Miami.

[10]​ Más tarde pasó por el Torneo de Río de Janeiro junto nuevamente a su dupla fija Granollers, dónde logró su segundo ATP 500 venciendo a los italianos Salvatore Caruso y Federico Gaio.

[11]​ En 2021, Zeballos se consagró campeón junto a Granollers en Madrid y Cincinnati consiguiendo así dos M1000 consecutivos en diferentes pistas en un lapso de 3 meses.

Entre esos torneos llegó a la final de dobles en Wimbledon con Granollers dónde cayó en cuatro sets ante los croatas (en ese entonces número 1 del mundo) Nikola Mektić y Mate Pavić por 4-6, 6-7, 6-2, 5-7.

Comenzó la temporada 2022 siendo finalista del Buenos Aires Open junto al italiano Fabio Fognini dónde fueron derrotados por Santiago González y su compatriota Andrés Molteni por 1-6, 1-6.

Sucedería lo mismo en Ginebra dónde hizo dupla con Granollers nuevamente, pero cedieron ante Murray y Michael Venus.