En genética y biología molecular, la homología de secuencias se refiere a la situación en la que las secuencias de dos o más proteínas o ácidos nucleicos son similares entre sí debido a que presentan un mismo origen evolutivo.
Dos especies que se hallan estrechamente relacionadas tendrán secuencias de ortólogos altamente similares.
Algunas otras bases de datos biológicas proveen herramientas para identificar y colectar secuencias ortólogas.
En otras palabras, si un gen de un organismo se duplica para ocupar dos posiciones diferentes en el mismo genoma, entonces las dos copias son parálogas.
Las secuencias o genes parálogos típicamente tienen la misma función o similar; no obstante, muchas veces este no es el caso debido a que no existe la misma fuerza selectiva original sobre la copia duplicada del gen; ésta puede adquirir nuevas funciones por mutación y por selección.