En 2001 también participó en dos carreras de la Fórmula 3 japonesa con el equipo Yellow Hat.

Al año siguiente participó en todas las carreras del campeonato japonés de F3 con el equipo Now logrando una victoria y una pole position además de dos podios, terminó 8.º en el campeonato.

Participó en la GP2 Series en su primera temporada para la escudería BCN Competición junto al venezolano Ernesto Viso.

Yoshimoto logró un podio y acumuló 14 puntos que lo dejaron en el 16.º lugar del campeonato.

Desde 2007 participa en la máxima categoría japonesa de monoplazas, la Fórmula Nippon con el equipo SG 5ZIGEN.