Allí conoció a Hans Driesch, Max Fürbringer y Haeckel.
A lo largo de esta década, Braus se convirtió en un anatomista comparativo e histólogo extremadamente competente, aprendiendo a dominar las nuevas técnicas experimentales y convirtiéndose él mismo en un introductor de nuevas técnicas, como la inyección de mercurio en las venas para hacerlas visibles en imágenes de rayos X (Braus, 1896) o su trabajo en la mejora de las lentes ópticas (Braus and Druner, 1897).
En 1899 Braus pasa a trabajar al laboratorio de Albert von Kolliker, en Wurzburg, donde entra en contacto con Theodor Boveri y Hans Spemann.
Bajo su influencia, Braus aplicó sus habilidades técnicas al estudio experimental del embrión.
En esta época, Braus aplica el enfoque experimental al problema de las extremidades, que antes había tratado desde una perspectiva puramente anatómica.