Hijo de Guillermo Bonilla y Rosa Mayta.
[1] Asimismo, fue admitido en el Instituto de Estudios Peruanos, donde ejerció como investigador (1970-1989).
[3] Ha enseñado también como profesor visitante en diversas universidades de América Latina, Estados Unidos y Europa; y ha sido investigador asociado al Woodrow Wilson Center de Washington D. C. (1974-1975) y al Institute for Advanced Study, en Princeton (1997).
[3] Ha escrito una veintena de libros (algunos en coautoría) y numerosos ensayos para revistas especializadas.
[2] En dicho ensayo desarrollaba la polémica tesis de que la independencia del Perú había sido concedida por ejércitos extranjeros bajo la dirección de San Martín y Bolívar.