[8]​[9]​ Hayabusa2 transporta múltiples cargas útiles científicas para detección remota, muestreo y cuatro pequeños rovers que investigaron la superficie del asteroide para informar el contexto ambiental y geológico de las muestras recolectadas.

(162173) Ryugu (anteriormente denominado 1999 JU3) es un asteroide de tipo C primitivo perteneciente al grupo Apolo.

No obstante, los científicos japoneses también quisieron hacerse con unas muestras más profundas que estuvieron menos expuestas a las condiciones extremas del espacio.

El aparato espacial comenzó el descenso hacia dicho cráter el miércoles 10 de julio y efectuó el propio aterrizaje el jueves 11 por la madrugada.

[20]​ Durante el segundo aterrizaje, la nave recolectó los escombros y algunas muestras que estaban a una mayor profundidad.

Después de haber recolectado las muestras necesarias, la sonda tomó algunas fotos al despegar.

[20]​ Se espera que la sonda continúe estudiando el asteroide hasta diciembre de 2019, cuando inicie su regreso a la Tierra.

[22]​ Cuando la sonda se aproxime al planeta liberará la cápsula que contenga las muestras del asteroide recogidas, la cual comenzará la reentrada en la atmósfera terrestre a una velocidad de 12 km/s.

Tras desplegar un paracaídas, la cápsula aterrizará en Woomera Test Range, al sur de Australia.

[25]​ Aunque es un valor bajo, la eficiencia del propulsante iónico permite cambiar la velocidad de la nave hasta 2 km/s.

[25]​ La nave cuenta con dos antenas direccionales de gran ganancia, que operan en las bandas X y Ka.

Para el descenso al asteroide, la nave depositará hasta cinco marcadores en la superficie del cuerpo.

Estos marcadores, cubiertos por material reflectante, serán reconocidos por un sensor a bordo de la nave.

[25]​ Hayabusa 2 cuenta con una gran cantidad de instrumentos científicos,[28]​[29]​ que abarcan diversas funciones.

A bordo de la nave se encuentran varias cámaras, un espectrómetro infrarrojo y un sistema LIDAR.

La misión cuenta con tres rovers y un aterrizador, cuya misión es investigar la superficie del asteroide in situ y proporcionar información de contexto para las muestras recogidas por la nave principal.

Una vez el dispositivo sea desplegado, la nave orbitará hasta situarse detrás del asteroide, momento en el cual la carga explosiva será detonada y el proyectil impacte contra la superficie del cuerpo.

[45]​ También se estudió una opción para realizar un sobrevuelo de Venus para establecer un encuentro con 2001 AV 43.