Haute-Kotto (francés: «Alta Kotto») es una de las 14 prefecturas de la República Centroafricana.

[1]​ Está situada en el centro-este del país, junto con Sudán.

Su capital es Bria.

Linda con las prefecturas de Vakaga al norte, Bamingui-Bangoran al noroeste, Ouaka al oeste, Basse-Kotto y Mbomou al sur, y Haut-Mbomou al este.

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