Hijo del matrimonio entre el señor Manuel Santos Aguilar y la señora Balbina de Jesús Hernández Pinto.

Además, firma un contrato con la "Conferencia Episcopal de Canadá" que ofrece construir un seminario y dirigirlo.

Con esto se quiere responder a un llamado del papa Juan XXIII a favor de América Latina.

Compareció a los Concilios Vaticanos y dio gran aporte a la educación magisterial, como eclesiástica del país, comisionando al Obispo Auxiliar de Tegucigalpa Monseñor Óscar Andrés Rodríguez Maradiaga para que coordinara la organización, creación y funcionamiento de la Universidad Católica de Honduras "Nuestra Señora Reina de la Paz".

El obispo Hernández fue condecorado con la Orden de Francisco Morazán, Grado Gran Cruz Placa de Placa, asimismo la comandancia de las Fuerzas Armadas de Honduras le reconoció su trayectoria nombrándole: Pastor y apóstol, Consejero, amigo y maestro'.