Esta subespecie fue descrita originalmente en el año 2017 por los ictiólogos Jack M. Craig, William G. R. Crampton y James S.
[1] Etimológicamente el término genérico Gymnotus proviene de la palabra del idioma griego gymnos, que significa 'desnudo'.
[3] El epíteto subespecífico caatingaensis es un topónimo que refiere a la región brasileña donde esta especie habita: la caatinga.
[1] Respecto a las restantes subespecies, Gymnotus carapo caatingaensis se caracteriza por tener una distancia postorbital larga, una cabeza corta, por una mayor longitud de las aletas pectorales y por tener la aleta anal corta.
Los resultados obtenidos arrojaron diferencias significativas, pero no diagnósticas, entre las distintas entidades encontradas, las que estaban delimitadas regionalmente, por lo que, para identificarlas taxonómicamente, se inclinaron por emplear la categoría de subespecie y no la de especie.