Nacido en Estocolmo, Suecia, tras finalizar sus estudios de secundaria, ingresó en la Universidad de Estocolmo, donde se formó entre 1919 y 1921.
Debutó en el cine en 1928 en la cinta de Gustaf Edgren Svarte Rudolf, dirigiendo su primera producción en 1929, el corto Finurliga Fridolf.
Además de su trabajo para el cine, dirigió varias obras en el Vasateatern y en el Östgötateatern.
Estuvo casado entre 1929 y 1943 con la actriz Signhild Björkman (1906-1994) y, desde 1944 hasta su muerte, con la también actriz Bibi Lindkvist (nacida en 1923).
Gunnar Skoglund falleció en 1983 en el Municipio de Nynäshamn, Suecia.