Fue el ministro de Gobierno de Bolivia desde 1997 hasta 1999 durante el segundo gobierno del presidente Hugo Banzer Suárez.

El año 1993, Guido Nayar fue candidato al cargo de diputado por el Departamento de Santa Cruz en representación del Acuerdo Patriótico AP (la cual era una alianza política entre los partidos políticos ADN y MIR).

En 1997, Guido Nayar participó en las elecciones de ese año como candidato al cargo de Senador por el Departamento de Santa Cruz en representación de ADN, pero esta vez no tuvo éxito ya que no logró obtener la votación mínima requerida para acceder al curul senatorial.

El año 1997, el Presidente de Bolivia Hugo Banzer Suárez nombró a Guido Nayar como el nuevo ministro de Gobierno del país.

Ese mismo año fugo del país al exterior.