Su acumulación en el cuerpo, como en casos de enfermedad renal crónica, está asociada con neurotoxicidad.No se debe confundir con la guanina, una de las bases que forman el ADN, ni con la guanosina, su nucleósido.Entre las sales importantes se incluye el hidrocloruro de guanidina, con propiedades caotrópicas, usado para desnaturalizar proteínas.El enlace central dentro de este grupo corresponde a una imina; los otros son aminales.Actualmente se está analizando la posibilidad de utilizar la guanidina como un combustible alternativo.