En 1885, 40 familias Bóer del noroeste de Sudáfrica se establecen en Grootfontein.

Cuando aquel territorio cayó bajo el control portugués, se volvieron atrás y trataron de establecer "la República Upingtonia" en Grootfontein.

Como todas las ciudades en el triángulo Otavi, Grootfontein es muy verde en verano, pero seco en invierno.

La principal motivación económica del área fue durante muchas décadas las minas Berg Aukas y Abenab al noreste de la ciudad.

Veinticuatro kilómetros al oeste de Grootfontein está el enorme meteorito Hoba.