El Gran Premio de Catar de Motociclismo de 2006 fue la segunda prueba del Campeonato del Mundo de Motociclismo de 2006.

Tuvo lugar en el fin de semana del 6 al 8 de abril de 2006 en el Circuito Internacional de Losail, situado en Doha, Catar.

La carrera de MotoGP fue ganada por Valentino Rossi, seguido de Nicky Hayden y Loris Capirossi.

Jorge Lorenzo ganó la prueba de 250cc, por delante de Andrea Dovizioso y Roberto Locatelli.

La carrera de 125cc fue ganada por Álvaro Bautista, Mika Kallio fue segundo y Sergio Gadea tercero.