Tiene su sede en la capital regional, la ciudad de Antofagasta.
Dentro de las facultades que le corresponden al Gobernador, es ser el órgano ejecutivo del gobierno regional, correspondiéndole presidir el consejo regional y ejercer las funciones y atribuciones que la ley orgánica constitucional determine, en coordinación con los demás órganos y servicios públicos creados para el cumplimiento de la función administrativa.
Asimismo, le corresponde la coordinación, supervigilancia o fiscalización de los servicios públicos que dependan o se relacionen con el gobierno regional, sin embargo su figura no es un representante del presidente de la República en la región, para tal representación la ley 20.990 creó el cargo de Delegado Presidencial Regional de Antofagasta.
El Consejo Regional o CORE Antofagasta es un órgano de carácter normativo, resolutivo y fiscalizador, dentro del ámbito propio de competencia del gobierno regional, encargado de hacer efectiva la participación de la ciudadanía regional y ejercer las atribuciones que la ley orgánica constitucional respectiva le encomienda.
Actualmente está integrado por 16 consejeros regionales elegidos por sufragio universal en votación directa, de cada una de las 3 provincias de la región (8 por Antofagasta; 5 por El Loa; y 3 por Tocopilla), duran 4 años en sus cargos y pueden ser reelegidos hasta por dos periodos.