Gloeomargarita es una cianobacteria en forma de bacilo, unicelular, gramnegativo, con metabolismo fotoautótrofo oxigénico y motilidad deslizante.
Estas muestras se mantuvieron en un acuario de laboratorio, aislándose de una biopelícula y se le denominó Gloeomargarita lithophora.
Contienen clorofila a, ficocianina y tilacoides fotosintéticos ubicados periféricamente.
El crecimiento se produjo tanto en medios de crecimiento BG-11 líquidos como sólidos, así como en agua alcalina.
[1] El análisis filogenético basado en proteínas plastidiales, ha revelado que conformaría un grupo independiente de las demás cianobacterias denominado Gloeomargaritales; grupo que formaría un clado hermano de los plastos de las plantas (clado Archaeplastida),[2] lo que tiene grandes implicaciones evolutivas, porque significaría que la primera célula vegetal, la microalga primigenia, sería producto de la simbiogénesis entre un protozoo huésped del clado Corticata y una cianobacteria endosimbionte del clado Gloeomargaritales.