Giseke comienza sus estudios en el "Academic Gymnasium de Hamburgo".
En 1764 asiste a la Universidad de Gotinga, graduándose en 1767.
Posteriormente expediciona por Francia y Suecia donde tiene encuentros con Linneo (1707-1778), pasando a ser discípulo y gran amigo.
Giseke jugó un gran rol en la introducción del método linneano a Alemania.
Linneo nombrará la familia de Gisekiaceae en su honor, y al género Gisekia L..