Tras una disputa con un préstamo pedido a la familia Putnam y con la comunidad por su paga, se marchó en 1683.
Residió en Falmouth hasta que un ataque de los wabanaki en 1689 la destruyó, instalándose entonces en Wells (Maine), que consideró más a resguardo de los ataques indios.
Diversos testimonios de las acusadoras llevaron al tribunal a considerar que Burroughs era el líder del "anillo de brujas" que afligía Salem.
Lo relata Robert Calef en Más Maravillas del mundo invisible, publicado en 1700: "El Sr. Burroughs fue llevado en la carreta con los otros, por las calles de Salem, a la ejecución.
Desde su caballo, calmó a los asistentes recordándoles que también el Diablo había sido un Ángel de Luz.