[1] Renunció o fue expulsado del Trinity College en 1571, probablemente por sus creencias religiosas, y en 1574 dejó Inglaterra para ir al Colegio Inglés de Douai.
Fue ordenado sacerdote en 1575 y se graduó en BST en la Universidad de Douai el mismo año.
Sus instrucciones le obligaron a trabajar en estrecha consulta con el jefe de la misión jesuita en Inglaterra.
Varios sacerdotes seculares en Inglaterra, pensando que Blackwell estaba demasiado cerca de los jesuitas, pidieron al Papa que revocara el nombramiento de Blackwell y nombrara un vicario apostólico con plenos poderes episcopales.
Después de la conspiración de la pólvora, Blackwell escribió a Roma y obtuvo una carta del Papa Pablo V condenando el complot y pidiendo a los católicos ingleses que no perturbaran la paz.
Durante los siguientes diez días fue interrogado varias veces sobre si había estado al tanto del complot de la pólvora y sobre su opinión sobre el juramento.
Al final de ese período se le ofreció el juramento, que prestó.