Aunque no cura la infección existente, se recomienda la vacunación para las personas VPH positivos, ya que puede proteger contra una o más cepas diferentes de la enfermedad.

Las cepas de VPH contra las cuales protege el Gardasil, son transmitidas sexualmente.

Para su máxima eficacia, se recomienda que las niñas reciban la vacuna antes de volverse sexualmente activas.

[21]​ En 2024, la vacuna contra el virus del papiloma humano (VPH) sigue siendo un componente clave en los programas de salud pública a nivel mundial.

Se ha ampliado el acceso a la vacunación en diversos países, con un enfoque en la inmunización de adolescentes y jóvenes adultos.

Además, nuevas investigaciones han explorado la eficacia de la vacuna contra variantes emergentes del virus.

El Instituto Nacional del Cáncer menciona: «Se ha demostrado que Gardasil y Cervarix proporcionan protección contra las infecciones cervicales persistentes del tipo VPH 16/18 hasta por 8 años, el cual es el tiempo máximo de seguimiento que se ha investigado hasta el momento.

Los CDC recomiendan que las vacunas se administren mediante dos dosis en seis meses.

Gardasil también es eficaz en los hombres, proveyendo protección contra las verrugas genitales, cáncer anal y algunas lesiones potencialmente pre-cancerosas causadas por algunos tipos de VPH.

La vacunación se espera que proteja contra el cáncer de pene y el cáncer anal causado por los tipos de VPH incluidos, y la investigación en esta área está en curso.

[8]​ La vacuna Gardasil ha demostrado disminuir significativamente el riesgo de contraer verrugas genitales en hombres jóvenes.

Los pacientes deben permanecer sentados durante 15 minutos después de que reciban la vacuna del VPH.

[41]​ Un estudio Permanente Kaiser siguiendo 190 000 chicas y mujeres tras la vacunación por dos años encontraron que las tasas de los trastornos autoinmunes lupus, la artritis reumatoide, la artritis reumatoide juvenil, la trombocitopenia idiopática púrpura (ITP) la anemia hemolítica, la esclerosis múltiple, tiroiditis y la diabetes mellitus tipo 1 en personas vacunadas eran las mismas que en las personas no vacunadas.

Al no hallarse una relación causal entre los síntomas y la vacuna, pero no poderse determinar tampoco un diagnóstico etiológico que explicase el problema de salud, las autoridades sanitarias plantearon la hipótesis de que lo sucedido podía responder a una sugestión colectiva, lo que generó una controversia científica y mediática, e hizo que la Corte Constitucional determinase en 2017 la no obligatoriedad en la aplicación de la vacuna y la necesidad de contar con un consentimiento informado para hacerlo.

Las proteína L1 están producidas por fermentaciones separadas en recombinantes de Saccharomyces cerevisiae y auto montado en VLPs.

[54]​ El Instituto Nacional del Cáncer (Estados Unidos) escribe: Si los efectos son temporales o para toda la vida, la vacunación generalizada podría tener un impacto sustancial en la salud pública.

[59]​ Estos resultados han sido importantes en decisiones para muchos países para empezar los programas de vacunación.

Sin embargo, mucho del material no se dirigió a la total complejidad de las cuestiones alrededor de la vacuna y no proporcionó recomendaciones mantenidas sobre los riesgos y beneficios.

En 1991, los investigadores australianos Jian Zhou y Ian Frazer en la Universidad de Queensland encontraron una manera de formar un virus como partículas (VLP) no infeccioso, el cual podía activar fuertemente el sistema inmune.

Sin embargo, estas VLPs, se ensamblaban pobremente y no tenían la misma estructura como el infeccioso VPH.

realizó un estudio de fase III llamado Mujeres Unidas para unilateralmente reducir Endo/Ectocervical Enfermedad (FUTURO II).

[67]​ Los grupos parentales protestaron el uso de la vacuna después que fue revelado que el productor de Gardasil, Merck & Co, estaba ejerciendo presión sobre legislaturas estatales para introducir vacunación obligatoria contra el VPH para chicas preadolescentes como un requisito para la asistencia al colegio.

[68]​ Algunas objeciones fueron debidas a la protección de la vacuna contra una enfermedad transmitida sexualmente, el papilomavirus humano, el principal agente causante del cáncer cervical.

Perry también ha permitido a los padres optar fuera del programa más fácilmente.

[73]​ La decisión de Perry más tarde fue criticada el 12 de septiembre, 2011 por los compañeros candidatos presidenciales Ron Paul y Michelle Bachman durante el debate presidencial del Partido Republicano como ser una extralimitación del poder estatal en una decisión debidamente dejada a los padres.

El gobierno federal canadiense utilizó 300 millones de dólares en tres años para ayudar a administrar la vacuna en todas las escuelas.

En 2007 los programas basados en la escuela provincial usaron el dinero para vacunar a los niños en edad escolar.

Los debates se convirtieron en controversia por la escala de edad utilizada para ser vacunados y porque en el momento que la vacuna estaba empezando a ser usada, no había datos a largo plazo provistos por los ensayos clínicos.