Fue fundada en 1905 y debe su nombre a Diágoras de Rodas, atleta griego del siglo V a. C..

El equipo fue disuelto por las autoridades italianas en 1929 para volver a fundarse en 1945.

El mejor resultado conseguido en la Copa de Grecia fue la llegada a las semifinales de 1986/87 en las que fue derrotado por el OFI Creta que después se alzaría con el título.

En febrero del 2012, cuando el equipo militaba en la Beta Ethniki fue expulsado de todos los torneos profesionales nacionales.

En 2017 el club retorna a la competición en la Gamma Ethniki.