Estudió matemática e historia natural por la Universidad de Berlín, y comenzó su carrera en 1840, como asistente de Martin Lichtenstein (1780–1857) en el Museo de Historia Natural de Berlín (Museo Humboldt).
En 1849, fue profesor de zoología, e historia natural en la Universidad de Bonn.
Troschel es recordado por las identificaciones y clasificaciones de especies en los campos de la malacología, ictiología y herpetología.
Y, algunas especies que contienen su epónimo son: estrellas de mar Evasterias troschelii, Chlorurus troschelii, Murex troschelii, Bithynia troschelii.
La abreviatura Troschel se emplea para indicar a Franz Hermann Troschel como autoridad en la descripción y taxonomía en zoología.