Empezó a trabajar para la agencia de viajes Caribbean Dreams Island Travel and Tours en Eleuthera, en las Bahamas.
En algún punto tras hacer esta llamada, Frank fue reclutado como piloto por la organización a la cual Matthew Abaddon pertenece.
Cuando se acercaba, hubo un fallo eléctrico y el resto de los pasajeros tuvieron que lanzarse al vacío con paracaídas.
Frank pudo aterrizar el helicóptero sin problemas y ningún daño significativo.
Aunque aterrizó con seguridad, recibió golpes en la cabeza y su teléfono satélite quedó inutilizable.
Un rato después se desmayó, pero despertó cuando Jack Shephard y el equipo lo encontraron.
De camino al carguero, el helicóptero se vio forzado a cruzar una tormenta.
Más tarde, tras una discusión con Keamy, Frank cambió el teléfono satélite a Sayid por la pistola de este.
Dejaron la habitación y vieron a Omar atando un dispositivo al brazo de Keamy.
En respuesta a esto, Keamy rajó la garganta de Ray, el médico, y arrojó su cuerpo por la borda.
Justo cuando despegaban, Frank envolvió un teléfono satélite en una prenda y cuando alcanzaron la isla lo lanzó a la playa que estaban sobrevolando.
Frank aterrizó el helicóptero a cinco kilómetros de la estación Orquídea, y Keamy y sus hombres le dejaron atado a una esposas para que no huyera, dejándolo allí.
Tras escapar de la Isla con Kate Austen, James "Sawyer" Ford, Hugo "Hurley" Reyes, Jack Shephard y Sayid Jarrah, Frank llevó el helicóptero hacia el Kahana, cuando detectó una fuga de combustible.
Al poco tiempo encuentran un barco donde estaba Penny y Frank sube en este.
3 años después, se revela que Lapidus recuperó su trabajo de piloto y ha estado haciendo viajes alrededor del mundo.
En las barracas, se encuentran con Christian Shephard, quien revela que los sobrevivientes restantes han viajado a través del tiempo hasta 1977.
A su regreso, Frank descubre que la pasajera Ilana encontró armas en la isla y reclamó el liderazgo del grupo.
Sin embargo, Hurley hace explotar el barco para evitar más riesgos; destruyendo todos los suministros de dinamita.
Después de que Hurley le cuenta su plan para hablar con el Hombre de Negro y Richard sigue su plan para destruir el avión, Frank se une a Hurley, junto con Jack y Sun.
Su grupo luego se fusiona con el campamento del Hombre de Negro.
Richard y Miles lo encuentran mientras se dirigen a la isla Hydra para volar el avión de Ajira.