Ese mismo año, Juan Bautista de Morales le recluta voluntario para realizar misiones en oriente.
La costa de Fujian venía siendo atacada por Coxinga, leal a la dinastía Ming, que mantuvo una gran actividad entre 1624 y 1662.
Varo se dedicó a estudiar la lengua china, tanto el idioma mandarín como el dialecto local.
Fue de los pocos que consiguió dominar la complicada forma del lenguaje empleado en el sistema legal y en las audiencias oficiales.
Pero sin duda su obra más importante sería Arte de la lengua mandarina (1703), la primera gramática de una lengua china que se ha conservado y que fue publicada tras su muerte.