Al término de este se retiró de la política activa, hasta volver en 2003 como diputado plurinominal del PRI a la LIX Legislatura.

El 5 de julio de 2009 es electo nuevamente diputado federal plurinominal a la LXI legislatura por la quinta circunscripción y nombrado coordinador del grupo parlamentario del PRI.

Como miembro del PRI fue presidente Nacional de la Fundación Colosio, A.C.

2007 - 2010, Miembro del Consejo Político Nacional y de la Comisión Política Permanente, y ocupó varios cargos: Secretario de Finanzas del Comité Ejecutivo Nacional, Coordinador del área de Prioridades Nacionales en la Campaña Política a la Presidencia de la República de Miguel de la Madrid, Miembro del Consejo Consultivo del Instituto de Estudios Políticos, Económicos y Sociales IEPES, Miembro del Consejo Político Nacional y Presidente del Patronato de la Fundación Luis Donaldo Colosio.

Su hermano Carlos Rojas Gutiérrez ha ocupado también cargos destacados en el gobierno como senador de la República, diputado federal y secretario de Desarrollo Social.