En 1562 es hecho preso por motivos desconocidos y posteriormente sufre una enfermedad.

[1]​ En 1571 vuelve a Madrid, donde se reincorpora a la Contaduría Mayor y al Consejo de Hacienda, destacando su labor en el marco de los graves problemas financieros que atraviesa la monarquía.

En 1579 llegaría a ser teniente de la Contaduría mayor.

El año siguiente pide permiso para regresar a Segovia para atender sus asuntos particulares.

En el año 1577 el Cabildo de Segovia le concedió la Capilla de Santiago, en la Catedral de Segovia, la primera entregada a un civil.