Se distinguieron los antepasados paternos del abad por su valor en el combate y brillaron por su papel como constructores, especialmente en la ciudad de Granada, donde se edificó el monasterio de San Jerónimo para honrar los restos y la gloria del Gran Capitán.

El padre del abad de Rute atendía su morada en Granada y una finca en La Zubia.

Construyó otra casa en Loja y la capilla de San Francisco en Granada que dejó sin terminar.

Su entrañable amistad con D. Luis de Góngora se remontaría a los años juveniles en los que éste visitó por primera vez la ciudad granadina.

Durante su estancia romana, D. Francisco Fernández de Córdoba profundizó sus conocimientos en literatura italiana y latina y presenció polémicas literarias, como la que se desarrolló en torno al Pastor fido de Guarini, en 1586-1594.

Epitafio latino para el sepulcro del obispo Pascual, 1607[8]​ Soneto en lengua toscana1608[9]​ Dedicado al libro Antigüedad y Excelencias de Granada, del Licenciado granadino Francisco Bermúdez de Pedraza (1585- 1655), Madrid, ed.

Soneto en lengua española, 1610 En Francisco de Luque Fajardo, Relación de la Fiesta que se hizo en Sevilla a la Beatificación del glorioso San Ignacio..., Sevilla, 1610.

Se supone que por aquel entonces fue cuando le pidió su parecer a su amigo, Francisco Fernández de Córdoba.

[10]​ Francisc0 Fernandii de Cordova Cordubensis, Didascalia multiplex, Nunc primum in lucem emissa.

Cum quinque indicibus necessariis, Lugduni, Sumptibus Horatij Cardon, 1615 Obra redactada en latín que se presenta como un recolección de ensayos eruditos que abarcan temas tan diversos como la teoría literaria (cap.

Los fondos en pergamino comienzan con algunos documentos del año 1236, año en que se reconquista la ciudad por Fernando III el Santo, transcritos en el manuscrito 10, en el que se copiaron varias bulas de Gregorio IX.

En 1516 ingresa la rica colección de incunables, casi todos ellos procedentes del legado testamentario del obispo don Martín Fernández de Angulo (1510-1516).

Corresponde a una publicación del texto manuscrito precedente, esta Historia también se publicó en el Boletín de la Real Academia de Ciencias y Bellas Letras y Nobles Artes de Córdoba, LXXII (1955), (pág.