Francesco nació en Mesina (Italia) con el apellido de Marulì, aunque el apellido a veces se encuentra como “Mauroli”.

Francesco por lo tanto recibió una educación “lascariana” a través del mismo padre, y de Francesco Faraone y Giacomo Genovese, también discípulos de Láscaris, cuya influencia es reconocible.

[3]​ Murió en 1575 de muerte natural, durante una epidemia de peste debido a que el matemático se había retirado en “Contrada Annunziata” (una zona a las afueras de Mesina), donde los Marulì poseían una villa familiar que, probablemente, en el pasado, a veces había albergado la academia mesinesa de la que el científico había formado parte.

Mantuvo correspondencia con otros estudiosos de la época como Clavius y Federico Commandino.

Entre 1548 y 1550, fue huésped del marqués Giovanni II Ventimiglia en el castillo de Pollina en Sicilia, utilizando la torre del castillo para realizar observaciones astronómicas.