Desde 1983 Itapirú forma parte de una isla debido a una gran inundación que alteró la geografía del lugar haciendo que el riacho Yacaré (desprendimiento del Paraná) desemboque en el río Paraguay.
Pero una creciente del río Paraná en 1848 destruyó la batería paraguaya y la isla fue evacuada.
En noviembre de 1865 Francisco Solano López restauró la artillería del fuerte colocando 6 piezas en él.
La fortaleza recibió 1.500 bombas desde la costa argentina (batería de Corrales), las isla Cabrita y desde la escuadra brasileña.
El Combate del Banco Purutué (o Combate de la isla de Redención) se produjo el 10 de abril cuando los paraguayos intentaron desalojar a los brasileños del banco Purutué enviando 29 canoas con 1.260 hombres al mando del teniente coronel José Eduvigis Díaz, pero fueron rechazados con grandes pérdidas y debieron retroceder hostilizados por la escuadra brasileña, la que también debió retirarse por el fuego lanzado desde Itapirú.