Nacida en Caracas, Flor Núñez estudió Derecho pero, desde sus comienzos, amó ser actriz.
Comenzó su carrera en 1977 Venevisión con la telenovela La Zulianita de Venevisión y su primera protagonización se llevó a cabo en 1980 con Buenos días, Isabel junto a José Bardina, lo que llevó a realizar diversas telenovelas y series en esa misma cadena televisiva, tanto como protagonista como contrafigura.
En 1991 firma contrato con RCTV para encarnar a la malvada Pastora Lara Portillo en El desprecio, junto a Flavio Caballero y Maricarmen Regueiro, lo que significó un hito en su carrera.
En 2007 vuelve a RCTV con Mi prima Ciela, siendo su último papel en esa televisora Posteriormente trabaja para Telemundo en El rostro de Analía.
En 2016 estrenó en Miami el monólogo Memorias de Tere, el cual fue especialmente escrito para ella por Carlos Roa Viana y Eduardo Haiek.