Ahora los personajes ya tienen predestinado su oficio, pero este cartucho de 2 MB traía la posibilidad de guardar hasta cuatro partidas diferentes (en Final Fantasy I solo podíamos guardar una) y un modo para memorizar palabras clave de una conversación y poder utilizarlas posteriormente.

Huyendo de los monstruos del emperador, los cuatro son atacados y dados por muertos.

Ella ha establecido una base rebelde en la cercana ciudad de Altaira, denominados Rosa Salvaje.

Ella lo reconoce como el anillo de Scott y le pide a Firion que lo guarde, diciéndole que es el anillo de un hombre valiente.

Reconociendo su fuerza, Hilda le pide al grupo ir a Salmandia para buscar mitrilo, ya que Josef, un miembro de la rebelión que fue enviado a buscarlo, no ha regresado e Hilda no ha oído nada de él desde que se fue a Salmandia.

Esto le da a la resistencia la oportunidad perfecta para destruir el Acorazado antes de que se termine.

Un plan es llevado a cabo para utilizar el Piroluz del reino de Kasuan pero para entrar, necesitan ya sea la Campana Divina o la voz de un Kasuanes.

Con la ayuda de Leila, una capitana pirata, el grupo alcanza Deist pero descubren que sólo un Drago sigue vivo.

Sin embargo, la bestia se está muriendo, envenenada por el imperio.

El grupo vuelve a Altaira con las manos vacías y para su sorpresa la Hilda que rescataron en el Acorazado no es realmente Hilda, sino una Reina Lamia a la cual derrotan.

Sin embargo, el Emperador de Palamecia, que los estaba supervisando personalmente, atrapa y encierra al grupo en los calabozos.

Hilda y Gordon escapan por sí mismos, mientras que el resto del grupo atrae la atención de los guardias.

Las ciudades de Altair, Gatrea, Paloom y Poft han sido destruidos por un Ciclón invocado por el Emperador.

A pesar de sus poderosos conjuros y su habilidad para hacer descender meteoros, el Emperador es finalmente derrotado y al fin se disipa en la nada, condenado al infierno que dirigió contra el mundo durante tanto tiempo.

Sin embargo, León se muestra escéptico de su propio futuro.

El juego incluye un sistema de batallas por turnos en el que los personajes mediante una serie de comandos ejecutan distintas acciones con diferentes efectos condicionados por unos atributos y equipamientos.

Piro, Electro, Hielo, Cura, Morfeo, Mutis, Tiniebla, Maldición, Trastorno, Televiaje, Exilio, Paro, Antimagia, Niebla, Trueque, Escudo, Coraza, Espejo, Prisa, Petra, Locura, Confu, Pestañeo, Shock, Rana, Aura, Lázaro, Toxis, Drenaje, Esna, Muerte, Aspir, Sanctus, Fulgor y Artema,Destrucción,Reavivar.

En 2001, Squaresoft sacó a la venta una nueva versión de Final Fantasy II para la WonderSwan Color en Japón, ofreciendo mejoras en cuanto a gráficos y sonido, pistas adicionales, nuevas opciones avanzadas en el sistema de juego y secuencias adicionales que muestran el progreso de la historia.

Finalmente, en el año 2004 la compañía fusionada Square-Enix vuelve a sacar a la venta un nuevo relanzamiento de Final Fantasy I y II para la GameBoy Advance, titulado Final Fantasy I & II: Dawn of Souls, en esta ocasión agregando nuevos escenarios y nuevos enemigos (personajes de otros títulos de la serie).