Como alcalde, emprendió demoliciones y reconstrucciones después del Bogotazo.
Su padre, que en otro matrimonio tuvo nueve hijos más, tuvo problemas económicos, por lo que Mazuera no pudo continuar sus estudios y debió asumir su mantenimiento, pudiendo sin embargo aprender mecanografía y taquigrafía.
Tras la muerte de Castillo, tomó el contrato para vender traviesas al Ferrocarril del Noreste.
Tras el Bogotazo, en 1948, el alcalde recién nombrado Manuel de Vengoechea desapareció durante los hechos y Mazuera reasumió el cargo.
En 1965 fundó la empresa urbanizadora Fernando Mazuera y Compañía Limitada, con la particularidad de que los proyectos arquitectónicos empezaban su nombre con la letra M, siendo Ciudad Modelia uno de los primeros.