Permaneció en España hasta 1596, cuando regresó a los Países Bajos.
En 1606 Felipe Guillermo fue reconocido en las Provincias Unidas como Señor de Breda y Steenbergen, y su derecho a nombrar magistrados fue reconocida, a condición de que él mantuviera la "Unión y la religión de la República".
Él debidamente hizo su entrada ceremonial a la ciudad de Breda, en julio de 1610 y desde entonces hasta su muerte, nombró regularmente los magistrados en su señorío.
Tuvo una diferencia con los Estados Generales en 1613, cuando se anuló el nombramiento de una doctrina católica.
Él tenía que cooperar con el gobernador militar en Breda, su medio hermano ilegítimo Justino de Nassau, incondicionalmente leal a los Estados Generales.