Fue criado en la corte real de su medio hermano el rey Cristián III.
Después de la división del estado de Schleswig y Holstein en 1544, se tuvo que encontrar una solución para proporcionar a Federico un ducado porque no querían fragmentar aún más el país.
Sin embargo, las negociaciones con otras diócesis fracasaron.
Fue nombrado Obispo de Schleswig y en 1551, se postuló como Obispo de Hildesheim, pero no se consagrado como protestante.
Se encuentra enterrado en la Catedral de Schleswig, descansando junto a sus padres.