Ya en 1663, los turcos habían penetrado profundamente en Hungría.

El ejército imperial del emperador Leopoldo I de Habsburgo comenzó a organizar una defensa común contra los turcos y exigió que Baden-Durlach también debía proporcionar tropas.

Federico VI participó en esta guerra como un general de división.

El Emperador concedió, incluso antes de que estallara la guerra, a Federico y su primo, el margrave Guillermo I de Baden-Baden, el derecho a utilizar el título de Alteza Serenísima, que fue hereditario hasta 1803, cuando el Margrave Carlos Federico en 1771 reunificó el margraviato de Baden y fue elevado a elector después de haber ampliado enormemente su territorio durante la mediatización alemana, siendo ascendido a Gran Duque en 1806.

Luis Guillermo, el primo de Federico, se distinguió en los combates contra los turcos y se ganó el apodo de "Turkenlouis" ("Luis el turco").