Era sobrino del duque sin hijos Cristián Luis I de Mecklemburgo-Schwerin.
Mecklemburgo se dividió de nuevo en dos partes con una autonomía limitada.
Los antiguos campesinos podían arrendar su tierra y el trabajo forzoso debía ser reemplazado por el trabajo por un salario.
Federico Guillermo tuvo numerosas amantes, con las que engendró al menos nueve hijos, entre ellos: Una dama llamada Federica Guillermina nació 1702 en Boizenburg y murió en 1748 en Schwerin.
En 1719, se casó con Hermann Cristián de Wolffradt (muerto en 1723 en Dömitz).