En 1942,[2]​ abrió su primera sucursal en el centro de Guadalajara, Jalisco (Farmacias Guadalajara López Cotilla), y actualmente cuenta con más de 2700 superfarmacias en 32 estados del país.

Asimismo, aparece en la Bolsa Mexicana de Valores, en donde su clave es FRAGUAB.

[cita requerida] Al año siguiente, en el 2019 se realiza la apertura de la Superfarmacia #2000 dentro del territorio mexicano y durante ese mismo año se expande al sureste del país abriendo su primera sucursal en el Estado de Quintana Roo.

[16]​ Farmacias Guadalajara, desde 1989 y hasta la actualidad, consta de una SúperFarmacia, el cual es una fusión entre farmacia, tienda de conveniencia y supermercado dirigida a todo estrato socioeconómico.

También se pueden ubicar en plazas y centros comerciales que van desde áreas pequeñas como lo son las plazas express y strip centers e incluso ubicarse en centros comerciales con áreas más grandes que van desde power center y community center hasta fashion malls, estos últimos con el objetivo de ayudar y animar al consumidor a complementar sus compras de último momento en Farmacias Guadalajara luego de realizar sus compras en las tiendas anclas de dichos centros comerciales en cuestión.