En esta institución se dictan carreras relacionadas con el área de ingeniería, agrimensura, geología y ciencias naturales.

Los primeros antecedentes de la facultad se remontan a 1808 cuando el rector Gregorio Funes creó la cátedra de aritmética, álgebra y geometría, que comenzó a funcionar al año siguiente.

[1]​ En 1875 el entonces presidente Nicolás Avellaneda decretó que la Universidad de Córdoba debía proceder a organizar a la brevedad su Facultad de Ciencias Matemáticas y Físicas.

Entre sus primeros profesores se encuentran: Oscar Doering (física), Adolfo Doering (química), Luis Brackebusch (mineralogía), Jorge Hieronymus (botánica), Hendrik Weyenbergh (zoología) y Francisco Latzina (matemáticas).

En 1918 comenzó una rebelión estudiantil en la Universidad Nacional de Córdoba que desembocó en la reforma universitaria, que logró la autonomía universitaria, el cogobierno, los concursos públicos de oposición y antecedentes, entre otras cuestiones.

Entre sus investigadores se encuentra la bióloga Sandra Díaz, especialista en diversidad funcional y en el efecto del cambio climático sobre la biodiversidad, que ha sido reconocida con diversos premios a nivel nacional e internacional.