Y fue quien refutó al naturalista Christian Gottfried Ehrenberg (1795–1876) el concepto de que los organismos microscópicos son similares a los animales superiores.
En Foraminifera, describe la sustancia denominada sarcode; con la cual nace el nombre de protoplasma acuñado por Hugo von Mohl (1805-1872).
Dujardin también fue investigador de otros invertebrados, incluso equinodermos, helmintios y cnidarios.
Friedrich Karl Christian Ludwig Büchner en su libro Fuerza y materia, comenta: Léase lo que refiere Dujardin sobre la inteligencia de las abejas.
se emplea para indicar a Félix Dujardin como autoridad en la descripción y taxonomía en zoología.