[3]​ En el Campeonato Mundial de 2003 celebrado en París, mantuvo una dura pugna con su compatriota Stephen Cherono, quien recientemente se había nacionalizado catarí y había cambiado su nombre por el de Saif Saaeed Shaheen.

En un emocionante final, Shaheen superó a Kemboi en los últimos metros, y este se tuvo que conformar con la plata.

Dolidos por su marcha, los responsables kenianos se valieron del reglamento olímpico para impedir que participara en los juegos, ya que, hasta tres años después del cambio de nacionalidad, un atleta no puede tomar parte en unos juegos si su anterior país no le deja.

[5]​ En la final, Kenia hizo triplete, siendo oro Kemboi (8:05,81), plata Brimin Kipruto y bronce Paul Kipsiele Koech.

Con este triunfo, se convirtió en el segundo atleta, después del finlandés Volmari Iso-Hollo, en ganar dos títulos olímpicos en los 3000 metros obstáculos.